Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP46P62068 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP46P62068 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP46P62068 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP46P62068 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP46P62068 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP46P62068 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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