Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA1P59665 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA1P59665 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms