Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BACE1P56817 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BACE1P56817 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BACE1P56817 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BACE1P56817 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BACE1P56817 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms