Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PAX9P55771 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms