Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLMP54132 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLMP54132 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLMP54132 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLMP54132 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLMP54132 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLMP54132 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLMP54132 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLMP54132 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BLMP54132 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BLMP54132 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BLMP54132 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BLMP54132 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLMP54132 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLMP54132 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLMP54132 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLMP54132 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLMP54132 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLMP54132 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLMP54132 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms