Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RND2P52198 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RND2P52198 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RND2P52198 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RND2P52198 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RND2P52198 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RND2P52198 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RND2P52198 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RND2P52198 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RND2P52198 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RND2P52198 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RND2P52198 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RND2P52198 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RND2P52198 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RND2P52198 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms