Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRIM1P49642 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRIM1P49642 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms