Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACADSBP45954 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACADSBP45954 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms