Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGIRP43119 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGIRP43119 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGIRP43119 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGIRP43119 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGIRP43119 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms