Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC1A1P43005 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms