Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPOP42166 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMPOP42166 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMPOP42166 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMPOP42166 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMPOP42166 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMPOP42166 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPOP42166 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPOP42166 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPOP42166 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPOP42166 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMPOP42166 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMPOP42166 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMPOP42166 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMPOP42166 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms