Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFI27P40305 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFI27P40305 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFI27P40305 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFI27P40305 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFI27P40305 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFI27P40305 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFI27P40305 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFI27P40305 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms