Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	YDR194W-A	YDR194W-A	153 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	RPS24B	YIL069C	408 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	TEN1	YLR010C	483 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	UNG1	YML021C	1080 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	OST2	YOR103C	393 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	ALG8	YOR067C	1734 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	GCD10	YNL062C	1437 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	HMRA2	YCR096C	360 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YDR193W	YDR193W	399 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YDR413C	YDR413C	576 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	PBA1	YLR199C	831 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	ICY1	YMR195W	384 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	NSL1	YPL233W	651 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	SWT1	YOR166C	1377 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	UTP13	YLR222C	2454 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	snR8	snR8	190 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	RPS13	YDR064W	456 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	PAU10	YDR542W	363 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	CDC26	YFR036W	375 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YGL042C	YGL042C	306 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YGL165C	YGL165C	579 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	PAU11	YGL261C	363 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	PAU13	YHL046C	363 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	MCM22	YJR135C	720 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	PAU4	YLR461W	363 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	HHF2	YNL030W	312 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YPT53	YNL093W	663 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	ZEO1	YOL109W	342 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	ROX1	YPR065W	1107 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	LTP1	YPR073C	486 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YCK2	YNL154C	1641 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	RNH70	YGR276C	1662 nt		3.46	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	ROY1	YMR258C	1662 nt		3.46	□□□□□ -1.85
YBR053C	P38235	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YGR242W	YGR242W	309 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YIL054W	YIL054W	318 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	ERP4	YOR016C	624 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YPR039W	YPR039W	336 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	NTC20	YBR188C	423 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	PEX5	YDR244W	1839 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YLR230W	YLR230W	306 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	OST6	YML019W	999 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	SRC1	YML034W	2505 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	MAL33	YBR297W	1407 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	snR65	snR65	100 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	HOP2	YGL033W	657 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YDR061W	YDR061W	1620 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	ARF1	YDL192W	546 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	MRH1	YDR033W	963 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YER097W	YER097W	330 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	RPL19B	YBL027W	570 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	VTI1	YMR197C	654 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		3.43	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	LAG1	YHL003C	1236 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YLR302C	YLR302C	363 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.42	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	GRX2	YDR513W	432 nt		3.41	□□□□□ -1.86

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