Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGFBR1P36897 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms