Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP5C1P36542 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms