Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USP6P35125 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP6P35125 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP6P35125 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP6P35125 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP6P35125 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP6P35125 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP6P35125 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP6P35125 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP6P35125 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP6P35125 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP6P35125 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP6P35125 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP6P35125 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP6P35125 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP6P35125 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms