Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCKARP32238 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKARP32238 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKARP32238 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKARP32238 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKARP32238 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms