Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AL162253.1-201ENST00000443792 758 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD11P31277 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC005154.1-201ENST00000434399 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD11P31277 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms