Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC13P31276 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXC13P31276 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms