Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA9P31269 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA9P31269 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms