Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND3P30281 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND3P30281 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms