Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMO2P25791 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMO2P25791 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMO2P25791 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO2P25791 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO2P25791 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms