Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTAFRP25105 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms