Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR2AP24928 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2AP24928 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms