Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNE1P24864 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms