Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPREP23469 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPREP23469 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPREP23469 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPREP23469 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPREP23469 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPREP23469 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPREP23469 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPREP23469 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms