Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA1P21709 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms