Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD33P20138 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD33P20138 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD33P20138 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD33P20138 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD33P20138 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD33P20138 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD33P20138 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD33P20138 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms