Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A1P19634 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A1P19634 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.7 ms