Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG1P18858 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LIG1P18858 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LIG1P18858 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIG1P18858 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG1P18858 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG1P18858 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG1P18858 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms