Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DESP17661 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DESP17661 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DESP17661 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DESP17661 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DESP17661 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DESP17661 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DESP17661 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DESP17661 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DESP17661 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms