Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CD44P16070 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD44P16070 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD44P16070 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD44P16070 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD44P16070 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms