Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF3P15923 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF3P15923 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF3P15923 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCF3P15923 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF3P15923 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF3P15923 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF3P15923 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCF3P15923 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCF3P15923 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms