Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GP1BBP13224 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GP1BBP13224 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms