Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC1P11047 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms