Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RARBP10826 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARBP10826 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARBP10826 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARBP10826 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARBP10826 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARBP10826 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARBP10826 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms