Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA3P0C7M3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA3P0C7M3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms