Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRB1P04280 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRB1P04280 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PRB1P04280 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB1P04280 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB1P04280 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB1P04280 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRB1P04280 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB1P04280 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB1P04280 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms