Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG7O95352 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG7O95352 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG7O95352 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG7O95352 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms