Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF40O75150 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF40O75150 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF40O75150 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF40O75150 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF40O75150 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF40O75150 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms