Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG13O75143 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG13O75143 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG13O75143 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG13O75143 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG13O75143 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG13O75143 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms