Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR3O43761 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYNGR3O43761 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms