Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRTM2O43300 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRRTM2O43300 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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