Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GRIN2DO15399 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms