Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TULP1O00294 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TULP1O00294 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TULP1O00294 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TULP1O00294 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TULP1O00294 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms