Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H7C0C1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H7C0C1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C0C1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C0C1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H7C0C1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H7C0C1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H7C0C1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H7C0C1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H7C0C1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H7C0C1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms