Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
B4DXG7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
B4DXG7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
B4DXG7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
B4DXG7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
B4DXG7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
B4DXG7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
B4DXG7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
B4DXG7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
B4DXG7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
B4DXG7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms