Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC169A6NNP5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC169A6NNP5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms