Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms