Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTAGE9A4FU28 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTAGE9A4FU28 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms